工程師很容易理解DNA技術(shù)
說(shuō)實(shí)話(huà),筆者對生物學(xué)曾經(jīng)不以為然。說(shuō)來(lái)慚愧,可能因為筆者在高中的時(shí)候沒(méi)學(xué)好孟德?tīng)柖?,由此認定生物學(xué)是一門(mén)非常復雜、需要死記硬背的科目。筆者的專(zhuān)業(yè)是物理學(xué)及其應用,而不知為什么日本的生物學(xué)家中有不少人否定還原論,以及通過(guò)研究和實(shí)驗增長(cháng)知識的科學(xué)觀(guān),這也是筆者抵觸生物學(xué)的原因。
不過(guò),國外有幾項生物技術(shù),尤其是與DNA相關(guān)的研究,卻跟物理學(xué)和工學(xué)研究非常相似。筆者在學(xué)生時(shí)代讀過(guò)的、由發(fā)現DNA構造的沃森(J.D.Watson)編著(zhù)的《雙螺旋》是非常有趣的一本書(shū)。這既是一本非常棒的研究筆記,又能讓外行像讀最好的推理小說(shuō)一樣津津有味地閱讀,可以體驗到研究的驚險和興奮。筆者完全沒(méi)有感覺(jué)到物理學(xué)、工程學(xué)與生物學(xué)的隔閡。
為撰寫(xiě)報道,筆者大致了解了一些DNA的相關(guān)研究成果。通過(guò)學(xué)習,筆者還認識到DNA及其作用其實(shí)就是將“生命的設計信息”翻譯成蛋白質(zhì)合成的一種信息通信技術(shù)。DNA也有相當于通信編碼和糾錯技術(shù)的機制。DNA分析技術(shù)則跟現有的通信技術(shù)相似。比如,首先放大微弱的信號,然后進(jìn)行分析。
進(jìn)步神速超過(guò)超級計算機
DNA分析技術(shù)的進(jìn)步史也跟計算機和半導體技術(shù)非常相似。比如,分析技術(shù)大幅提高了速度。解讀人類(lèi)DNA中的30億個(gè)堿基對序列的“DNA測序”在1990年代之前大部分采用人海戰術(shù)。筆者有個(gè)從事DNA研究的大學(xué)同學(xué)就經(jīng)常抱怨連睡覺(jué)的時(shí)間都沒(méi)有。
而到了2000年代以后,分析程序的自動(dòng)化和并行化迅速發(fā)展,“分析速度2年提高了大約10倍”。那么10年就提高10萬(wàn)倍。半導體技術(shù)在1年半~2年內集成度和工作性能提高到了原來(lái)的2倍,超級計算機的速度2年提高了約4倍,10年提高了約1000倍,由此可見(jiàn)DNA分析技術(shù)的進(jìn)步有多快。在1990年代,解讀人類(lèi)DNA所有堿基對需要幾年時(shí)間,而現在只需1~2天即可完成。
“實(shí)驗室”內的微細化跟半導體一樣
不過(guò),直到幾年前,DNA分析技術(shù)大多還是化學(xué)方法?;瘜W(xué)的檢查技術(shù)不斷“微細化”,過(guò)去晃動(dòng)試管的工作已逐漸被整個(gè)實(shí)驗室建立在芯片上的“芯片實(shí)驗室(Lab-on-a-chip)”技術(shù)所取代,并且還推動(dòng)了DNA分析技術(shù)的巨大進(jìn)步。但是,即使解讀時(shí)間縮短,所使用的光分析裝置的小型化速度卻沒(méi)有能象分析時(shí)間那樣縮短得那么快。到現在,主要的分析裝置大多還有大衣柜那么大,能放到放在桌子上的儀器已算是非常小的了。
最近,電子技術(shù)終于走進(jìn)生物學(xué)領(lǐng)域,打破了以往的裝置常識,大幅減小了產(chǎn)品尺寸并提高了精度。比如,2012年英國OxfordNanoporeTechnologies公司推出的DNA分析裝置跟U盤(pán)差不多大,可拿在手里。
電子技術(shù)的參與是在化學(xué)技術(shù)的小型化之后才實(shí)現的。雖然晃動(dòng)試管的工作與電子技術(shù)沒(méi)有聯(lián)系,但芯片實(shí)驗室技術(shù)可以自然地理解為該工作要依托半導體芯片。順便一提,流感病毒直徑大約為100nm,剛好跟10年前的半導體設計規則差不多。